Joe Higan adalah seorang Nukenin - mantan ninja yang melarikan diri dari klannya dan bersembunyi dari masa lalunya yang kejam di pedesaan Amerika bersama keluarganya. Suatu malam, dia disergap oleh tim pembunuh dari mantan organisasinya yang menuntut pembalasan berdarah pada Joe dan keluarganya karena mengkhianati kode kuno mereka. Bangkit dari "kematiannya" yang tampak, Joe akan muncul kembali sebagai dirinya yang dulu - Ninja Kamui - untuk membalaskan dendam keluarga dan teman-temannya. Kamui adalah ninja abad ke-21, anakronisme bayangan yang mengadu keterampilan kunonya dengan persenjataan berteknologi tinggi dengan kemahiran brutal. Dia harus berhadapan dengan pembunuh terlatih, cyborg tempur, dan ninja saingan untuk menjatuhkan klan yang membuatnya.