Dalam waktu dekat, kenaikan air laut yang tiba-tiba dan tidak dapat dijelaskan telah meninggalkan banyak peradaban manusia di bawah air. Ikaruga Natsuki, seorang anak laki-laki yang kehilangan ibu dan kakinya dalam kecelakaan beberapa tahun sebelumnya, kembali dengan kekecewaan dari kehidupan yang keras di kota besar untuk menemukan rumah pedesaan lamanya yang setengah tertelan oleh laut.

Ditinggalkan tanpa keluarga, yang dia miliki hanyalah kapal dan kapal selam yang ditinggalkan oleh nenek ahli kelautan, dan hutangnya.

Satu-satunya harapannya untuk mengembalikan impian masa depan yang telah hilang adalah mengambil kesempatan yang diberikan kepadanya oleh penagih utang yang mencurigakan Catherine. Mereka berlayar untuk mencari reruntuhan laboratorium neneknya yang tenggelam untuk menemukan rumor harta karun yang mengatakan dia pergi dari sana.

Tetapi apa yang mereka temukan bukanlah kekayaan atau permata; itu adalah seorang gadis aneh yang tertidur di peti mati di dasar laut. Atri.

Atri adalah robot, tetapi penampilan dan kekayaan emosinya akan menipu siapa pun untuk berpikir bahwa dia adalah manusia yang hidup dan bernafas. Sebagai rasa terima kasih karena telah diselamatkan, dia membuat pernyataan kepada Natsuki.

"Aku ingin memenuhi perintah terakhir tuanku. Sampai aku melakukannya, aku akan menjadi kakimu!"

Di sebuah kota kecil yang perlahan diselimuti oleh lautan, musim panas yang tak terlupakan akan segera dimulai untuk anak laki-laki dan gadis robot misterius ini...